第二軍醫大學出版社于1997年經國家新聞出版署批準成立，系由解放軍總后勤部主管、第二軍醫大學主辦的中央級醫學科技專業出版社。出版社下設編輯部、發行部、出版部、儲運部、財務部、辦公室等。

第二軍醫大學出版社辦社宗旨是以本校門類齊全的學科、雄厚的師資力量、高水平的科研成果和地處上海的優勢為依托，面向全軍，服務全國，努力實施精品戰略，多出優秀作品。為振興醫學教育和出版事業不懈努力，為社會主義物質文明和精神文明建設服務。

建社8年多來，已出版圖書500余種，有多部學術著作獲獎，如《肝膽病理學》、《實用外科重癥監護與治療》、《神經肽基礎與臨床》分別獲第二、三、四屆“中國人民解放軍圖書獎”，多本圖書獲第四、五屆華東地區大學出版社優秀教材學術專著一等獎和二等獎。《護理心理學》等獲全國高校優秀暢銷書獎。 本社為醫學編輯碩士研究生培養點，擁有一支思想解放、業務精湛的編輯、出版、發行隊伍。另外，還編輯出版《第二軍醫大學學報》（中文版）、《軍醫大學學報》（英文版）等優秀學術性刊物，書刊互動，優化了出版資源。 面對愈加激烈的競爭形勢，本社將進一步面向市場，優化選題，突出重點和特色，樹立品牌。

以本校門類齊全的學科、雄厚的師資力量、高水平的科研成果和地處上海的優勢為依托，面向全軍，服務全國，努力實施精品戰略，多出優秀作品