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基于輻射防護基因集的抗輻射損傷先導化合物預測
關鍵詞：先導化合物 輻射防護劑 基因表達譜 轉錄組數據 lincs計劃
摘要：目的利用基于網絡的細胞反應印記整合文庫(LINCS)計劃的小分子化合物刺激不同細胞系的轉錄譜數據,構建算法評估化合物的抗輻射損傷活性,發現抗輻射損傷先導化合物。方法基于基因本體(gene ontology,GO)數據庫構建輻射防護基因集,并基于基因集富集分析算法構建算法評估化合物的抗輻射損傷潛能,預測具有抗輻射損傷活性的先導化合物。結果建立了4個具有抗輻射損傷效果的輻射防護基因集,以及利用轉錄組數據預測抗輻射損傷先導化合物的方法;在32 560個小分子化合物中預測獲得了299個抗輻射損傷先導化合物,其中17個已被報道具有抗輻射損傷活性。結論預測結果具有較好參考價值;預測方法速度快,成本低,可有效發現具有抗輻射損傷活性的化合物。
軍事醫學雜志要求:
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