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基于線粒體基因組的鼠兔高海拔適應(yīng)機(jī)制探討

賀玉姣; 馬永貴; 謝惠春; 都玉蓉; 張同作; 蘇建平 中科院西北高原生物研宂所青海省動(dòng)物生態(tài)基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 西寧810000; 中國(guó)科學(xué)院大學(xué); 北京100864; 青海師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 青海省青藏高原動(dòng)植物資源重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 西寧810000

關(guān)鍵詞:鼠兔 線粒體 高海拔 nadh脫氫酶 

摘要:鼠兔隸屬于兔型目,大多生活在海拔較高的地區(qū),是研究哺乳動(dòng)物對(duì)高寒缺氧環(huán)境適應(yīng)機(jī)制的理想模型。線粒體通過(guò)氧化磷酸化產(chǎn)生能量,在機(jī)體的氧氣利用和能量代謝中發(fā)揮重要作用。本研究測(cè)定了柯氏鼠兔線粒體全基因,然后分析了5種分布于較高海拔的鼠兔與6種較低海拔的兔科物種的線粒體基因組,并探討了鼠兔高海拔適應(yīng)時(shí)線粒體基因的作用。研究表明相比于較低海拔物種,鼠兔積累了更多的非同義突變,并且在鼠兔的線粒體編碼基因的NADH2、NADH4L、NADH4、NADH5、NADH6、Cytb上均檢測(cè)到正選擇信號(hào)。ND2、ND4和ND5亞基的正選擇位點(diǎn)位于非跨膜區(qū),鼠兔的ND4L、ND6亞基的正選擇位點(diǎn)位于TM區(qū),但并不在與質(zhì)子轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的關(guān)鍵區(qū)域。NADH脫氫酶亞基可能通過(guò)氨基酸變異干擾了質(zhì)子轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程的有效性。Cytb上的正選擇信號(hào)位于跨膜螺旋H,氨基酸的變異可能影響到泛醇的結(jié)合與轉(zhuǎn)移,進(jìn)而改變了能量代謝。

基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)雜志要求:

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基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)

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