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利用BSA-seq發掘棉花適宜機采的果枝長度相關QTL
徐劍文; 劉劍光; 趙君; 王希睿; 肖松華 江蘇省農業科學院經濟作物研究所/農業部長江中下游棉花和油菜重點實驗室; 南京210014; 南京市標準化研究院; 南京210019
關鍵詞：棉花 株型育種 果枝長度 機采棉 qtl
摘要：【目的】將群體分離分析法與下一代測序技術相結合,定位與棉花果枝長度關聯的數量性狀位點。【方法】以Ⅰ式果枝品系蘇機棉125和Ⅱ式果枝品種泗抗1號為親本,構建棉花F2分離群體。根據F2群體單株中部果枝節間平均長度,選擇極端性狀單株分為2組,構建DNA混池。再對2個混池進行重測序,分析2個混池之間的單核苷酸多態性和插入缺失突變,并利用歐式距離法關聯與果枝節間長度相關的數量性狀位點。【結果】利用測序獲得的單核苷酸多態性位點數據,在A3染色體上定位到1個與果枝節間長度關聯的區域,區間范圍為0.8Mbp;利用測序獲得的缺失突變位點數據,也在A3染色體上定位到1個關聯區域,區間范圍為1.09Mbp;2個關聯區域互相重合,重合區間為0.77Mbp。【結論】本研究中Ⅰ式果枝相關基因被定位在A3染色體上,說明棉花Ⅰ式果枝和〇式果枝的差異是因為遺傳位點和模式的不同,而不是同一基因的劑量效應。
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