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環(huán)貴州喀斯特高原湖泊環(huán)境中的細菌多樣性
關(guān)鍵詞：環(huán)高原湖泊環(huán)境 細菌 純培養(yǎng)法 高通量測序
摘要：采用純培養(yǎng)方法,選用6種培養(yǎng)基對23份環(huán)貴州喀斯特高原湖泊環(huán)境土壤樣品中的細菌進行分離培養(yǎng),經(jīng)初步形態(tài)排重后共獲得83株細菌純培養(yǎng)物。菌株的16S rRNA基因序列信息顯示,這些菌株歸屬于3門12目15科19屬,優(yōu)勢細菌類群為鏈霉菌屬(Streptomyces)、芽胞桿菌屬(Bacillus)、短芽胞桿菌屬(Brevibacillus)和北里孢菌屬(Kitasatospora)。同時采用高通量測序分析的方法評估了這些土壤樣品中的細菌群落結(jié)構(gòu)特征。環(huán)境樣品中16S rRNA基因的V3~V4區(qū)序列分析顯示,從土壤樣品中檢測到分屬于17門36目74科130屬的細菌,涵蓋喀斯特高礦物質(zhì)環(huán)境、鹽堿湖泊環(huán)境、森林土壤環(huán)境中存在的優(yōu)勢菌群,其中變桿菌屬(Variibacter)、慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)以及嗜酸棲熱菌屬(Acidothermus)為優(yōu)勢屬,體現(xiàn)出該生境中細菌群落結(jié)構(gòu)的獨特性。綜合純培養(yǎng)和高通量測序分析結(jié)果,環(huán)貴州喀斯特高原湖泊環(huán)境樣品中細菌群落特征和環(huán)境之間存在著明顯相關(guān)性,其中蘊含著豐富的細菌資源,值得進一步挖掘。
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