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馬鈴薯PGA1基因的克隆及序列分析
關(guān)鍵詞：馬鈴薯 pga1基因 基因克隆 序列分析
摘要：糖苷生物堿是馬鈴薯塊莖中普遍存在的一種有苦味的毒性甾類生物堿,其毒性可使人、動物變畸形或死亡,PGA1基因是催化糖苷生物堿合成的關(guān)鍵酶基因。通過同源克隆的方法,采用RT-PCR技術(shù)對馬鈴薯大西洋品種的PGA1基因進(jìn)行克隆,獲得了PGA1基因的cDNA序列;并對馬鈴薯PGA1基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,PGA1基因的CDS全長為1497 bp,編碼498個(gè)氨基酸,所編碼蛋白的分子質(zhì)量為57.087 ku,理論等電點(diǎn)為9.29,為不穩(wěn)定蛋白;該蛋白的二級結(jié)構(gòu)包括α螺旋(52.41%)、β轉(zhuǎn)角(6.02%)、延伸鏈(12.85%)和無規(guī)則卷曲(28.71%),其中,α螺旋和無規(guī)則卷曲為主要元件,與預(yù)測的蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)一致。研究結(jié)果可為進(jìn)一步深入了解PGA1基因的功能和調(diào)控機(jī)制,利用基因工程技術(shù)調(diào)控馬鈴薯中糖苷生物堿含量提供理論依據(jù)。
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