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基于全基因組測序的蒙古馬運動相關的正向選擇基因篩選
關鍵詞：蒙古馬 運動性狀 全基因組測序 正向選擇
摘要：旨在從基因組水平對蒙古馬運動性狀涉及的相關基因進行分析。本研究利用全基因組測序技術,對蒙古馬的血液進行采樣和基因組測序,并且結合人、牛、小鼠等7種哺乳動物的基因組數據,對蒙古馬的特有基因和正向選擇基因進行篩選。分析數據得到已注釋的蛋白編碼基因19475種,并篩選出了38種蒙古馬特有基因和45種正向選擇基因。根據GO富集、KEGG通路富集分析和前人研究,發現包括MAPK13、CCN2、FSCN3、BTG1、TF等17種正向選擇的蛋白編碼基因可能參與蒙古馬的運動過程。這些運動相關正向選擇基因的生物學功能涉及到肌動蛋白絲結構、心肌收縮的正調節、鈣離子結合、調節細胞內pH、血管生成、膠原生物合成過程的正調節等。而7種miRNAs(包括eca-miR-302c、eca-miR-8974、eca-miR-9077等)則通過與mRNA的3′UTR區域作用分別潛在靶向調控運動相關的MAPK13、LOC100057755、EHD4、MICAL3、TMBIM1和F11R。以上涉及的運動相關正向選擇的蛋白編碼基因可以促進人們對于蒙古馬運動性狀的了解,并為靶向競技型的家畜育種提供分子理論基礎。
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