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蔥蘭夜蛾幼蟲腸道細菌群落結(jié)構(gòu)與多樣性分析
關(guān)鍵詞：蔥蘭夜蛾 幼蟲 腸道細菌 多樣性 16s
摘要：為明確蔥蘭夜蛾Brithys crini(Fabricius,1775)幼蟲腸道細菌的群落結(jié)構(gòu)和多樣性,利用IonS5TMXL高通量測序平臺對腸道細菌16S rDNA基因V3-V4變異區(qū)進行測序,應(yīng)用Cutadapt、Uparse等軟件整理、統(tǒng)計樣品序列數(shù)和OUT數(shù),分析腸道細菌的物種組成、豐度和多樣性。4個蟲體腸道樣本測序拼接后,共得273 453條序列和在97%相似度下平均每個樣本可聚類為512個OTU數(shù)目,總共注釋到23門57綱86目168科347屬,優(yōu)勢菌群為變形菌門Proteobacteria和厚壁菌門Firmicute。蔥蘭夜蛾腸道細菌Simpson指數(shù)、Shannon指數(shù)和Chao1指數(shù)分別為0.93~0.98,5.67~6.82和439.57~584.12。結(jié)果表明蔥蘭夜蛾幼蟲腸道細菌多樣性比較豐富,個體間微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性有差異。
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